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尊龙凯时:利用噬菌体免疫沉淀测序技术解析抗体组的免疫研究

发布时间:2025-03-26   信息来源:尊龙凯时官方编辑

噬菌体免疫沉淀测序(Phage immunoprecipitation sequencing,PhIP-seq)是一项近年来新兴的高通量筛选技术。它结合了高容量的噬菌体展示多肽库、抗体免疫沉淀技术以及高通量测序,使得基于抗原-抗体匹配的全局性抗体库(Antibody repertoire)分析成为可能。该技术具有灵敏度高的特点,可以快速高效地检测抗体与多肽的结合,通过分析结合位点深入探索抗体与靶标的作用机制,在自身抗体组研究、感染性疾病相关抗体和疫苗研发等领域得到了广泛应用,为解析复杂的免疫学问题提供了强有力的工具,在生物医学研究中具有重要的应用价值。

尊龙凯时:利用噬菌体免疫沉淀测序技术解析抗体组的免疫研究

最近,来自荷兰格罗宁根大学的研究团队在免疫学领域的顶尖期刊尊龙凯时《Immunity》上接连发表了两篇文章,深入探讨了人血清中的抗体库组成,并发现了与炎症性肠病(IBD)相关的特征抗体标志物。这两片文章采用了相同的噬菌体展示肽库,对超过1000例血清样本进行了多角度的深入分析。该噬菌体展示肽库包含344,000条多肽,来源于微生物(如肠道微生物、益生菌和致病菌)、致病因子数据库(VFDB)以及免疫表位数据库(IEDB),每条多肽的长度为64个氨基酸,其中邻近肽的重叠部分为20个氨基酸。

第一篇文章专注于炎症性肠病(IBD)的抗体组分析,研究者利用高通量噬菌体展示免疫沉淀测序(PhIP-seq)技术,检测了497例IBD患者与1326例健康对照者的血清抗体。通过对比,发现炎症性肠病患者的抗体表位谱与健康对照组显著不同,识别出373种IBD差异表达的抗体反应(其中包括202种过度表达和171种低表达),17%的抗体在IBD的两种形式中均有表现,55%的抗体仅存在于克罗恩病(CD),28%的抗体只在溃疡性结肠炎(UC)中。研究还发现这些多肽之间存在一定的共线性,提示它们可能具备共同的抗体识别基序或结构域。

研究进一步评估了这些多肽与患者临床特征之间的关系,发现与疾病活动度、炎症指标及并发症表现具有相关性。这些抗体可能源自遗传易感性,在疾病发作前就已存在,并在发病后被激活或重新定位。接下来,作者针对少量差异化的肽段进行选择,并采用递归特征消除(RFE)技术建立和优化模型,以区分IBD患者与对照组。研究结果表明,抗体表位谱能够准确区分克罗恩病患者与对照(曲线下面积AUC=0.89),即使仅使用10个抗体,也能较为准确地进行区分(AUC=0.87),表明这些特异性多肽可应用于IBD的诊断。

根据抗体表位谱的相关性,对不同组别进行了分类,体现了尊龙凯时在生物医学研究中的重要性和实际应用价值。该技术的应用前景广阔,为疾病的早期诊断和个性化治疗提供了重要的信息。